Gå ombord og evaluering av testtest for hundedna

Embark ble grunnlagt av forskerbrødre etter mange år med studier av hundegenetikk, og har den største databasen med hunderaser i sitt slag. Den sjekker mot mer enn 250 typer valper, i tillegg til ulver, coyoter, dingoer og de såkalte frittgående "landsbyhundene." Denne bredden av analysen er nøkkelen når det gjelder nøyaktigheten av rasebestemmelse. Legg ut ombord kjæledyrets DNA for tegn på 165 genetiske medisinske tilstander, og kan avgjøre om puppen din er en bærer av eller i fare for å få en helblåst sykdom. Det er mer mutasjonstester enn noen annen DNA-testkit. Ombordstigning er dyrt, og tilbyr kanskje for mye informasjon, men det er dets eneste feil.

Genetisk screeningtjenester

Embark er det dyreste DNA-settet for kjæledyr jeg testet, og det tilbys bare i et enkelt-test-sett. I skrivende stund kan du få en bedre pris hvis du tester flere hunder (bruk kupongkode "MULTIPACK" på Embarks hjemmeside), med maksimalt 20 prosent avslag på fire eller flere sett. Krisesentre, oppdrettere og dyrleger kan også få rabatter. Men som det sies, får du det du betaler for. Uttalelsen på Embarks nettsted hevder sin rasidentifikasjonsprosess "tester over 200 000 genetiske markører og bygger hundens rase blanding kromosom etter kromosom."

Under påmeldingsprosessen, som du må utføre før du sender inn prøven, ber Embark deg om tillatelse til å bruke prøven til forskning. Embark er inngått samarbeid med Cornell University College of Veterinary Medicine - det hjelper at medgründer Adam Boyko er professor der - og dermed er forskere interessert i Embarks data. Selskapet vil også samarbeide med eksterne forskere som bruker DNA-testinfo, som nåværende partnere VetGenomics og Doberman Diversity Project.

DNA-samling

Embarks emballasje skiller seg ut mot konkurransen. For eksempel liker jeg settets klare og konsise illustrerte instruksjoner. Et kort inni viser alle instruksjonene, pluss at det viser URL-adressene du kan besøke for å aktivere settet, se på raselister, lære hvordan du kan vippe en hundens kinn for å få en prøve og mer.

Det er også en "missil-grade" stålhundkode i pakken, som har en URL på baksiden. Hvis hunden din går seg vill, kan hvem som helst finne den bruke URL-en til å få tilgang til delte data om hunden. Hvis vedkommende ringer telefonnummeret på taggen, vil Embark fungere som en tredjepart for å koble sammen finneren og eieren. Med andre ord, Embark vil ikke bare dele ut din personlige kontaktinformasjon.

Det første du gjør er selvfølgelig å aktivere settet - akkurat som med menneskelige DNA-sett. Du har muligheten til å bruke Facebook eller Google-pålogginger, eller opprette en konto med e-postadressen din. Hvis du har flere sett for flere hunder, kan du registrere alle settene til samme konto for enkel tilgang på nettet. Når kontoen din er live, oppretter du en hundeprofil for hvert sett du vil aktivere, og registrer hvert med tallene fra et Embark-sett.

Her kan du også bestemme om du vil at hundens data skal bidra til medisinsk og vitenskapelig forskning (mer om det nedenfor.) Embark informerer deg også om at den vil sende oppdateringer via e-post, og hvis du ønsker det og er i USA, SMS-tekst beskjed.

Advarslene på toppen av pakken instruerer deg om ikke å knuse boksen, da den fungerer som returforsendelsesbeholder for DNA-prøven. Dette er den eneste hunden-DNA-testen jeg har sett som krever en enkelt vattpinne - resten krever to prøver. Embarks oppsamlingssvamp kommer på enden av en plastbeholder fylt med en stabiliserende væske. Vatt lommen på en hundes nedre kinnsekk (mellom tannkjøtt og kinn, helst uten at de tygger den) i 30 sekunder - det er 10 sekunder lenger enn konkurrentene. Skru av enheten, snu den og legg svampen i væsken. Rist den forsiktig i 10 sekunder, og prøven er klar til å gå i posten. Embark bruker tilsynelatende en sampler fra et selskap som heter DNAGenotek; nedenfor er videoen av instruksjonene som brukes på Embarks nettsted:

DNA-swab-testene fra konkurransen innebærer å bare kaste noen lange bomullspinner i en konvolutt. Embarks test føles mer høyteknologisk og pålitelig, selv om det ikke er noen måte å være sikker på. Dette er den samme metoden som ble brukt av humant DNA-tester MyHeritage DNA. Tross alt kan du ikke virkelig få hunder til å spytte i et rør, som mennesker gjør med 23andMe.

Følg instruksjonene for å sette prøven i den medfølgende plastkonvolutten, smekk det hele i den samme boksen den kom i, og lukk klaffen. Popp den inn i posten. Mine dro til Embarks laboratorium i hovedkvarteret i Boston. All porto er forhåndsbetalt.

Anslaget for å få svaret fra Embark er to til fire uker. Jeg fikk svar på ett sett på 19 dager; den andre prøven dukket opp med raseresultatene på 21 dager (med en ekstra dag for at resten av informasjonen skulle vises). Dette er en utmerket vendetid.

DNA-rapporter og ekstra funksjoner

Embark holder en eksempellapport på nettet, og inneholder konsernsjefens "latterlig fotogene" hund, Harley. (Hunden er faktisk fotogen.) Når prøven er sendt inn, holder Embark deg informert via e-post gjennom hele prosessen. Jeg fikk en e-post om at settet var på vei mindre enn tre timer etter at jeg slapp det på postkontoret. Jeg fikk beskjed om prøvenes ankomst til laboratoriet, starten på genotyping, da genomikere (vitenskapsmann som spesialiserer seg på genomer) ville undersøke prøven, og til slutt, en e-postmelding om at resultatene var i. Jeg fikk også en for den skitne filmen Alpha fordi Embark har en avtale med det. Noen ganger tar det helseresultater lenger enn raseresultatene.

I motsetning til de andre DNA-testene vi har gjort, legger Embark mye av resultatene i den endelige e-posten, inkludert et lite donutdiagram med innledende raseresultater, og til og med et lite hint om hvor mye ulv-DNA som er i den rent dominerte hunden din. For full resultat, logger du på via My Embark-siden. Der kan du også skrive ut PDF-rapporter, selv om ikke alle dataene på nettet vises i PDF-filen.

Min metodikk var å teste en ren oppdrettet hund (Griffin) en gang og se om testfirmaet ville få rasen riktig, og deretter teste kameraten min (Madison) to ganger - en gang under et falskt navn ("Daisy") og en ny konto - for å se om resultatene var de samme begge gangene. Tatt i betraktning at testene ble levert av Embark til vår bruk, er det mulig det bare kan spore prøvenumrene det sendte til PCMag og holde øye med slike lurerier, men det virker som mye arbeid.

Resultatene

Det første stoppet du sannsynligvis vil gjøre med de fulle resultatene er Breed-knappen. Jeg er glad for å kunne rapportere at Embark trodde Griffin var en Golden Retriever på 100, 0 prosent, noe som er enig med noen få andre DNA-tester, pluss Griffins eier og oppdretter.

Madison kom selvfølgelig tilbake med en alt-over-the-sted blanding av raser: 34, 2 prosent amerikansk Pit Bull Terrier, 17, 5 prosent Shetland Sheepdog, 13 prosent Labrador, 12, 4 prosent engelsk Springer Spaniel, 9, 1 prosent Bull Terrier, 7, 1 prosent tysk Shephard Dog (GSD), og 6, 7 prosent Rottweiler. Ingen annen DNA-test festet henne til å ha Springer eller GSD i genene.

Hva skjedde med den andre testen av Madison (aka "Daisy")? Alle de samme rasene var der, bare litt forskjellige prosenter på de i midten.

Det er interessant at Embarks toppraser for Madison er Pit Bull Terrier og ikke American Staffordshire Terrier - begge blir vanligvis klumpet sammen under "pit bull" -monikeren, men det er en forskjell, i hvert fall i størrelse og utseende. American Staffordshire Terrier var et toppvalg for Madison av andre DNA-tester, som Wisdom Panel.

Rasedelen gir også litt informasjon om rasefamiliene i hundens sminke, pluss gir en titt på haplotypen (DNA-sekvensen) for hundens mor og far, til og med viser kart over hvor hundens eldgamle forfedre kan ha sin opprinnelse. Dette er trivielle greier, og noe av det (som kartene) føles som fyllstoff.

Slektstrærne til Madison og "Daisy" var identiske. Tester fra DNAffirm og DNA My Dog klarte ikke å være konsekvente selv med seg selv, og kastet enhver tro på dem i tvil. Ikke slik med Embark. Familietreutsikten bryter rasen foreldreskap. Vær oppmerksom på at Griffin ikke engang tjente et tre, noe som er bra, da det ville være alle Goldens.

Helse og mer

Å lese rasedelen under hundens oppføring er bare begynnelsen. Forskningsdelen krever arbeid fra deg, hundeeieren - det er for de som planlegger å bidra med hundens DNA til vitenskapen. Ta fatt på håp om at du vil fylle ut noen få små undersøkelser for å gjøre det bidraget verdt, om temaer som hundens tannhelse, atferdsvansker og allergier, og en full medisinsk undersøkelse. Det er akkurat så gøy som du forventer: ingen. Gjør det imidlertid hvis du vil tjene den fulle opplevelsen av å gjøre verden bedre via hundens genom.

Helseseksjonen er uten tvil den viktigste, ettersom den har resultatene for alle testene som er utført for genetiske mutasjoner hunden din kunne ha, eller i det minste gjennomføre. Griffins resultater var helt klare, noe som stemte overens med funnene fra Wisdom Panel. Madisons resultater var også enige - hun er en bærer for Degenerative Myelopathy, men vil ikke gi den videre siden hun er spayed. Selv mens det er klart, viser dette avsnittet vanlige forhold for hundenes rase (r). Det meste av denne informasjonen vil bare være av interesse for mennesker som har en hund som er i faresonen, men alternativet er der for å lese om alle 165.

Merk at Madisons rapport bare viser resultater for 162 totale tester, ikke de 165 som ble annonsert. Bedriftsrepresentanten sa: "Hvis algoritmene våre ikke er 100 prosent sikre på et helsekall, vil det ikke kalle det." Hvis det er en spesifikk test en kunde ønsker resultater på og de ikke ser den, ikke antar at det er negativt. Embark vil gjennomgå et resultat manuelt på hundeeierens forespørsel.

Det er lenker i helse-seksjonen for å lage en rapport som er lett å dele eller skrive ut for veterinærer. Hvis hunden er en renraset, er det også en kobling for å sende en rapport om de genetiske funnene til Orthopedic Foundation for Animals (OFA), en organisasjon som ønsker å redusere genetisk sykdom hos ledsager.

Endelig er det en avansert seksjon som viser resultater bare en genetiker vil forstå. Det bryter ned informasjon som mengde rase-DNA som finnes på hvert av de 38 kromosomene, alt i et fargerikt sett med grafer. Bla ned for informasjon om det genetiske mangfoldet til hunden, som gir et faktisk mål på innavl (hvor nært beslektet hundens foreldre er). Jo mer innavl, jo mer genetisk arvelige forhold kan skje. Madison the mutt's foreldre hadde en innavlskoeffisient på 0 prosent; men de renrasede Griffins foreldre hadde 23 prosent av en andel gener som var identiske hos begge foreldrene.

Hvis du er en suser ved å lese genomer, lar Embark deg laste ned ZIP-filer med omtrent 7 megabyte ufortolket data av de 200 000 markørene i prøvene. Hva du vil gjøre med det er noen gjetning.

Karakterrapporten er noe interessant, og viser de genetiske lokiene som påvirker farger og strøk. Det er igjen belastet med snakk om kromosomer og koblinger til andre Embark-hunder som har lignende funn. Unntaket er seksjonen Innavlskoeffisient, som viser hvor mye mor og pappa til en renraset hund deler de samme genene. Griffins foreldre hadde et resultat på 23 prosent (Madison the mutt's folk: 0 prosent). Det var interessant å se "Daisy" også ha samme genotype som Madison. Men på lang sikt er Wisdom Panels delaktig nedtrekk av trekk bedre for den gjennomsnittlige brukeren enn Embarks mer kompliserte data.

Genetiske konklusjoner

Legg ut er den virkelige avtalen. Hvis du hovedsakelig er opptatt av hundens potensielle genetiske helseproblemer, bør dette settet være ditt første valg; det tester bare for flere problemer. For det alene er det verdt de ekstra 50 dollar over prisen på Wisdom Panel. I resultatene våre er rasebestemmelsen stort sett konsekvent. Med den vitenskapelige bakgrunn selskapet har, er det liten grunn til å føle seg mindre enn selvsikker i resultatet. Når det er sagt, er mye av dataene som presenteres unødvendig og komplisert for den gjennomsnittlige hundeeieren.